Physiologie, Pathologie et Génétique Végétales
L’Unité Propre (UP) de recherche de L’Ecole d’Ingénieurs de PURPAN (Institut National Polytechnique de Toulouse) « Physiologie, Pathologie et Génétique Végétales » (PPGV), a été créée début 2016, en lien avec la DGER (Direction Générale de l’Enseignement et de la Recherche) du Ministère de l’Agriculture, de l’Agroalimentaire et de la Forêt. C’est la première UP de PURPAN.
Elle a été conçue avec un triple objectif :
- regrouper des enseignants-chercheurs déjà associés sur différents programmes scientifiques et agréger leurs compétences dans un champ disciplinaire au sein de l’INP-PURPAN;
- constituer une nouvelle « Equipe d’Accueil de Doctorants » dans l’Ecole Doctorale SEVAB (« Sciences Environnementales, Vétérinaires, Agronomiques et Bio-ingénieries ») ;
- construire un projet structuré à travers lequel la qualification d’étudiants et des enseignants-chercheurs et la reconnaissance scientifique du groupe se développent à moyen terme pour envisager des stratégies d’alliance.
Notre objectif scientifique se scinde en 2 thématiques principales inscrites dans l’étude des interactions plante-environnement
(facteurs biotiques et abiotiques) :
– Compréhension des patho-systèmes et des mécanismes de défenses des plantes :
Les projets menés dans cette thématique ont pour but de caractériser les mécanismes de défense des plantes vis-à-vis de pathogènes vasculaires.
– Caractérisation des dynamiques d’accumulation d’agro-molécules d’intérêt :
Les projets ont pour but de comprendre l’expression de la variabilité de teneur et de composition en métabolites et macromolécules d’intérêt.
Axe 1 : Compréhension des patho-systèmes et des mécanismes de défenses des plantes
Thématique principale : Compréhension des interactions plante-microorganismes de l’esca.
Notre compréhension des étapes initiales de la colonisation du bois de vigne par les champignons associés à l’esca a été développée à partir d’un modèle de laboratoire que nous avons pu décrire dans un chapitre d’ouvrage publié en 2016 (Pierron et al., 2016a). Ces champignons sont Phaeocremonium minimum (P.min) et Phaeomoniella chlamydospora (P.ch).
Ce modèle s’est développé au sein de notre unité grâce à la mise en place d’un outil de détection moléculaire de ces 2 espèces dans le bois de vigne (Pouzoulet et al., 2013a).
Nous nous intéressons particulièrement au déroulement de la colonisation du bois de vigne dans les premiers mois de l’interaction. Les réponses de la plante sont analysées à l’échelle tissulaire par des approches microscopiques. L’étude des mécanismes moléculaires mis en place localement sur le site d’infection est l’objet d’approches utilisant les outils de la biologie moléculaire et de la biochimie.
Dans le cadre de ces études, nous travaillons avec différentes entreprises dans le but de développer des moyens de lutte innovants ciblant ces étapes précoces de l’infection.
Axe 2 : Caractérisation des dynamiques d’accumulation d’agro-molécules d’intérêt
Caractérisation des dynamiques d’accumulation d’agro-molécules d’intérêt.
Les édulcorants naturels de la stevia : les steviosides
Stevia rebaudiana Bertoni, une herbe vivace de la famille des Asteraceae originaire du Paraguay, est d’un intérêt croissant en tant que source d’édulcorants naturels acoloriques, les glycosides de stéviol (SVglys). Ces diterpénoïdes sont organisés autour d’un noyau de stéviol et diffèrent par le nombre et la nature d’unités de sucre qui lui sont conjuguées. Les SVglys sont accumulés à des concentrations allant de 4 à 20% de la masse sèche des feuilles, selon le génotype, le stade phénologique et les conditions de croissance.
Nous étudions les sources de variabilité génotypique et environnementale pour l’accumulation en SVglys et la production de biomasse foliaire. Une forte variabilité génotypique est observée pour la composition en SVglys et, à un degré moindre pour leur teneur totale, ainsi que pour des critères de précocité et les composantes du rendement. Nous avons montré l’effet de l’environnement (fertilisation, durée du jour, stade phénologique, âge de la plante) sur l’élaboration de la biomasse foliaire et sur la teneur en SVglys (Barbet-Massin et al., 2015). La composition en SVglys, moins affectée par ces facteurs est essentiellement sous déterminisme génétique (Petit et al., 2019).
C’est l’étude par forward et reverse genetics de ce déterminisme qui est l’objet de notre travail. La finalité sera de conduire des approches de sélection créatrice pour l’obtention de variétés d’intérêt agronomique et présentant des profils de glycosides de stéviol répondant aux attentes des industriels et des consommateurs.



Les enseignants-chercheurs
Les membres supports
Les non-permanents
Non-permanents | Thématique | période |
Ana ROMEO OLIVAN | Axe 1 | 2019-2022 |
Mirna AL SARRAJ | Axe 1 | 2020-2023 |
Thomas BAERENZUNG DIT BARON | Axe 2 | 2020-2023 |
Les anciens
Nom | Périodes | Axe | Aujourd’hui |
Marie-Pierre ARTIGOT | 2009-2012 | Axe 2 | Education Nationale |
Jérôme POUZOULET | 2008-2012 | Axe 1 | Postdoc à Bordeaux |
Claire BARBET-MASSIN | 2012-2015 | Axe 2 | Consultante Innovation Bloomoon |
Marielle PAGES | 2012-2015 | Axe 1 | Enseignante-Chercheuse à à PURPAN |
Romain PIERRON | 2011-2015 | Axe 1 | Maître de conférence, Université Haute Alsace |
Hélène MISSONNIER | 2014-2017 | Axe 1 | Sélectionneuse Caussade Semences |
Alexandra DUNHEN | 2014-2017 | Associée | |
Simon DUTHEN | 2015-2018 | Associé | Postdoc Toulouse |
Eva PETIT | 2016-2019 | Axe 2 | ATER à Bordeaux |
Robin BEGHIN | 2017-2020 | Associé | Enseignant-Chercheur à PURPAN |
Sylvain TREGUIER | 2017-2020 | Associé | CDI à Terre Innoviax |
- Axes thématiques
-
Notre objectif scientifique se scinde en 2 thématiques principales inscrites dans l’étude des interactions plante-environnement
(facteurs biotiques et abiotiques) :– Compréhension des patho-systèmes et des mécanismes de défenses des plantes :
Les projets menés dans cette thématique ont pour but de caractériser les mécanismes de défense des plantes vis-à-vis de pathogènes vasculaires.
– Caractérisation des dynamiques d’accumulation d’agro-molécules d’intérêt :
Les projets ont pour but de comprendre l’expression de la variabilité de teneur et de composition en métabolites et macromolécules d’intérêt.
Axe 1 : Compréhension des patho-systèmes et des mécanismes de défenses des plantes
Thématique principale : Compréhension des interactions plante-microorganismes de l’esca.
Notre compréhension des étapes initiales de la colonisation du bois de vigne par les champignons associés à l’esca a été développée à partir d’un modèle de laboratoire que nous avons pu décrire dans un chapitre d’ouvrage publié en 2016 (Pierron et al., 2016a). Ces champignons sont Phaeocremonium minimum (P.min) et Phaeomoniella chlamydospora (P.ch).
Ce modèle s’est développé au sein de notre unité grâce à la mise en place d’un outil de détection moléculaire de ces 2 espèces dans le bois de vigne (Pouzoulet et al., 2013a).Nous nous intéressons particulièrement au déroulement de la colonisation du bois de vigne dans les premiers mois de l’interaction. Les réponses de la plante sont analysées à l’échelle tissulaire par des approches microscopiques. L’étude des mécanismes moléculaires mis en place localement sur le site d’infection est l’objet d’approches utilisant les outils de la biologie moléculaire et de la biochimie.
Dans le cadre de ces études, nous travaillons avec différentes entreprises dans le but de développer des moyens de lutte innovants ciblant ces étapes précoces de l’infection.
Axe 2 : Caractérisation des dynamiques d’accumulation d’agro-molécules d’intérêt
Caractérisation des dynamiques d’accumulation d’agro-molécules d’intérêt.
Les édulcorants naturels de la stevia : les steviosides
Stevia rebaudiana Bertoni, une herbe vivace de la famille des Asteraceae originaire du Paraguay, est d’un intérêt croissant en tant que source d’édulcorants naturels acoloriques, les glycosides de stéviol (SVglys). Ces diterpénoïdes sont organisés autour d’un noyau de stéviol et diffèrent par le nombre et la nature d’unités de sucre qui lui sont conjuguées. Les SVglys sont accumulés à des concentrations allant de 4 à 20% de la masse sèche des feuilles, selon le génotype, le stade phénologique et les conditions de croissance.
Nous étudions les sources de variabilité génotypique et environnementale pour l’accumulation en SVglys et la production de biomasse foliaire. Une forte variabilité génotypique est observée pour la composition en SVglys et, à un degré moindre pour leur teneur totale, ainsi que pour des critères de précocité et les composantes du rendement. Nous avons montré l’effet de l’environnement (fertilisation, durée du jour, stade phénologique, âge de la plante) sur l’élaboration de la biomasse foliaire et sur la teneur en SVglys (Barbet-Massin et al., 2015). La composition en SVglys, moins affectée par ces facteurs est essentiellement sous déterminisme génétique (Petit et al., 2019).
C’est l’étude par forward et reverse genetics de ce déterminisme qui est l’objet de notre travail. La finalité sera de conduire des approches de sélection créatrice pour l’obtention de variétés d’intérêt agronomique et présentant des profils de glycosides de stéviol répondant aux attentes des industriels et des consommateurs.
- Membres de l'unité
-
Les enseignants-chercheurs
Les membres supports
Les non-permanents
Non-permanents Thématique période Ana ROMEO OLIVAN Axe 1 2019-2022 Mirna AL SARRAJ Axe 1 2020-2023 Thomas BAERENZUNG DIT BARON Axe 2 2020-2023 Les anciens
Nom Périodes Axe Aujourd’hui Marie-Pierre ARTIGOT 2009-2012 Axe 2 Education Nationale Jérôme POUZOULET 2008-2012 Axe 1 Postdoc à Bordeaux Claire BARBET-MASSIN 2012-2015 Axe 2 Consultante Innovation Bloomoon Marielle PAGES 2012-2015 Axe 1 Enseignante-Chercheuse à à PURPAN Romain PIERRON 2011-2015 Axe 1 Maître de conférence, Université Haute Alsace Hélène MISSONNIER 2014-2017 Axe 1 Sélectionneuse Caussade Semences Alexandra DUNHEN 2014-2017 Associée Simon DUTHEN 2015-2018 Associé Postdoc Toulouse Eva PETIT 2016-2019 Axe 2 ATER à Bordeaux Robin BEGHIN 2017-2020 Associé Enseignant-Chercheur à PURPAN Sylvain TREGUIER 2017-2020 Associé CDI à Terre Innoviax - Publications
-
- Contact
A PURPAN, la fonction d’enseignant-chercheur se décline en 3 missions : l’enseignement, l’accompagnement et une activité de Recherche / Développement / Conseil.
5 équipes de Recherche associées aux meilleurs organismes de Recherche française (INRA, CNRS, …).
10 plateformes et laboratoires à la pointe de la technologie.
PURPAN s'appuie sur plusieurs réseaux ou organisations pour développer ses activités de Recherche.
L'Europe et la région Occitanie soutiennent les projets de recherche de l'Ecole d'Ingénieurs de PURPAN.